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雲端超級運算建奇功! 科學家發現9種新冠狀病毒

科學家運用超級雲端運算,發現9種新冠狀病毒,或可讓人類提前防範。示意圖。(路透檔案照)

科學家運用超級雲端運算,發現9種新冠狀病毒,或可讓人類提前防範。示意圖。(路透檔案照)

2022/01/31 18:07

〔編譯陳成良/綜合報導〕加拿大英屬哥倫比亞大學(UBC)一位博士後研究員帶領一個國際研究小組,運用超級雲端運算,重新分析了所有公開的RNA測序數據,結果發現了比以前已知的RNA病毒多出近9倍的病毒,其中包括在一些意想不到的地方出現的9種全新冠狀病毒!

UBC週三(26日)發出的新聞稿稱,該校博士後研究員巴巴利安(Artem Babaian)領導一項名為「Serratus(鋸肌)」的研究計畫,針對過去13年於全球收集的570萬份生物樣本,包括來自數種動物的糞便,以及其他來源,總計高達2000萬個十億位元組(gigabytes)的基因序列數據,進行比對、分析之後,上週在著名的科學期刊《自然》上發表了研究成果。

巴巴利安稱,透過UBC與亞馬遜公司雲端運算平台(AWS)合作的「雲創新中心」(Cloud Innovation Centre),Serratus計畫得以在AWS上建立了一個非常強大的超級電腦,其功率相當於2萬2500個CPU(中央處理器)。

Serratus研究項目共發現13萬2000種RNA病毒(以前只知道1萬5000種)9種新的冠狀病毒物種。巴巴利安n估計,如果超級雲端運算能力,傳統的超級電腦需要花費1年多的時間和數十萬美元來完成這項分析工作,而Serratus在11天內以2萬4000美元(約新台幣66萬7000元)經費完成了這一任務。

巴巴利安表示,我們正進入一個了解自然界內病毒的遺傳和空間多樣性、以及各種動物如何與這些病毒相互作用的新時代。他希望,像類似SARS、武漢肺炎(新型冠狀病毒病,COVID-19)病毒「SARS-COV-2」這樣的病毒再次出現,我們不會措手不及,而真正目標是儘早發現這些感染問題,使它們永遠不會成為流行病。

巴巴利安舉出一名32歲、有不明原因發燒的病人為例子。他說,可以對患者的血液進行測序,並將引起發燒的病毒與Serratus項目的現有病毒數據庫進行比較,大家可在約2分鐘內搜索數據庫,然後與2012年在非洲撒哈拉以南取得的駱駝病毒樣本聯繫起來。

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