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進入翁啟惠此時被拉下台 立委︰內情不單純
時隔40天，總統馬英九前天批准中研院長翁啟惠於3月29日提出的辭呈。（記者吳柏緯翻攝）
〔記者蘇芳禾、林良昇、吳柏緯／台北報導〕馬英九總統前天同意中研院長翁啟惠請辭，並且希望中研院儘速安排遴選名單上之候選人來總統府面會。民進黨發言人楊家俍表示，尊重馬總統的職權，但距馬總統卸任只剩九天，民進黨早在四月間便建議總統儘速處理，為何卻拖了這麼久？總統府應對外說明，也希望建議馬總統再商酌。
民進黨︰為何拖這麼久？馬應對外說明
據了解，民進黨內層峰對於馬總統的舉措有點傻眼，因為新舊政府正在為了交接政務繁忙，卻還要處理中研院長這麼重要、複雜的事情。也好奇馬總統過去一個月不處理相關事務，「到底是遇到什麼困難？」如果是想要把球丟給民進黨政府，坦白說，目前已經進入法定程序，差別只在於馬英九或蔡英文勾選院長而已，對民進黨來說相對單純。
藍綠立委同樣對時機點感到錯愕。
距卸任剩9天 時機敏感 藍綠均感錯愕
民進黨立委黃國書認為「馬在背後算計」，內情不單純，可能想以院長請辭出缺相關規範，重啟遴選程序。民進黨立委何欣純表示，馬總統應尊重中研院是總統府最高學術幕僚單位，不該將手伸入院長遴選。
時力︰院長遴選名單 應交由蔡英文圈選
時代力量黨團總召徐永明說，中研院遴選名單適不適當，應交由蔡英文圈選決定，馬不該創造新紛擾。
國民黨立委賴士葆表示，馬總統在這時機點確實有點奇怪，但批准以前辭呈，並非沒有前例。且新中研院長遴選過程爭議很大，應該重新啟動遴選。
中研院院士李文華，以及身兼評議員的院士李文雄，都反對總統退回候選人名單，認為評議會依合法的遴選程序選出三位候選人並送交總統府，就應尊重。院士陳培哲則認為評議會更改選舉辦法不是什麼大事，更改後未經總統府核准就逕自執行，才是問題所在。
對於馬總統在致翁啟惠信函中，提及部分院士希望由七月院士會議重選新院長的言論，希望中研院正視，也引起中研院內部對於院長遴選流程的討論。
李文雄認為，許多院士並不在院內甚至台灣任職，反而是在院內工作的研究員或行政人員，更能理解中研院的狀況與需求，由評議會選出新任院長很合理。社會所研究員張茂桂也反對由院士會議選舉院長，指院士屬於榮譽職，做好自己該做的事即可，不應什麼事都想插手，未來則應讓院內的研究人員有更暢通表達意見與參與的管道，擴大院內人士共同參與。
